Kemudian, pasangan itu menjalani program IVF, yang menghasilkan kembar bernama Xavier dan Griffin pada tahun 2004. Pada tahun 2006, sekali lagi memiliki kembar kali ini, kembar bernama Kai, Saxon, dan Damian.
Pada 2008, Elon Musk dan Justine bercerai. Keduanya sepakat untuk berbagi hak asuh lima anak. Justine Wilson juga menulis dalam esai untuk Marie Clare pada 2010 bahwa dia merasa lebih seperti ‘karyawan’ untuk Musk daripada pasangan selama hubungan.
Hubungannya dengan Grimes yang memiliki tiga anak darinya juga tidak harmonis. Grimes mengakui bahwa dia mengalami kesulitan menghubungi Musk meskipun dia secara aktif berbagi tweet di X ketika meminta tanggung jawabnya atas kondisi medis anak mereka.
