Jadwal pemupukan harus dilakukan secara rutin setiap minggu hingga tanaman berumur enam minggu. Dosis yang dianjurkan adalah campuran 1 gram NPK (16-16-16) per polibag ke dalam 1 liter air, diberikan dalam satu gelas atau 200 ml per polibag. Cara pemberiannya dengan cara disiram atau disiramkan pada sekeliling pangkal tanaman, tidak langsung pada daun.
Selain NPK, saat tanaman berumur 1,5 bulan berikan pupuk tambahan berupa Urea dua gram per polibag. Pemberian urea pada fase ini sangat penting untuk merangsang perkembangan umbi secara optimal. Kebersihan lahan sekitar tanaman juga harus dijaga dengan melakukan penyiangan gulma pada umur dua minggu agar unsur hara pupuk terserap seluruhnya oleh bawang merah, bukan gulma.
